يختلف تنفس الكائنات تحت الماء, فالحيتان والتماسيح والفقمات تتنفس الهواء عن طريق الرئتين, فتخرج خارج الماء للتتنفس الهواء ثم تغوص في الماء, اما الأسماك فتتنفس عن طريق الخياشيم, ولا تستطيع العيش خارج الماء, واما البرمائيات مثل الضفدع فتتنفس الهواء خارج الماء, غير انها تحت الماء تتنفس عن طريق فتحات تنفسية في جلدها.