مسجد المعرس يقع في المدينه المنوره بالقرب من مسجد الميقات و بالتحديد في جنوب شرق المسجد على بعد مسافه 100 متر.
وتقع على طرف وادي العقيق المبارك وهو اشهر وادي في المدينه المنوره و قال عنه رسول الله صلى الله عليه وسلم: (( العقيق وادي مبارك)) والكثير من الناس من يظن ان هذا المسجد هو نفسه مسجد الميقات ولكن هذا الكلام غير صحيح.