إن إحدى الأعراض الجانبية من استخدام المضادات الحيوية هو التأثير على الكميات و الاتزان الحاصل في البكتيريا النافعة في أجسامنا و بسبب ذلك فإن قدرة هذه البكتيريا النافعة على مقاومة البكتيريا الضارة التي تسبب الالتهابات للجهاز البولي تكون قلت و يصبح الجسم عرضة بشكل أكبر للتعرض لهذه العدوى لذا من الممكن أن يسبب استخدام المضادات الحيوية التهابا في المسالك البولية نتيجة لذلك وبالتالي الشعور بألم ولكن استمرار الألم لفترة من الزمن يؤدي إلى القلق ويستوجب الذهاب إلى الطبيب للتأكد من السبب .