ان تقدم العلم يجعل من فروع عام النباتات تزيد وتتفرع اكثر واكثر ، وان اي فرع أساسي ممكن ان يتفرع الى افرع اخرى. وعلى العموم سنذكر الان بعض فروع علم النباتات الرئيسية:
١- فرع التصنيف حيث يصنف النباتات الى عائلات واصول وفروع وأنواع .
٢- فرع التشريح حيث يبين التفاصيل التركيبية لمكونات النباتات.
٣- فرع الشكل الخارجي ويهتم بأشكال النباتات الظاهرة أطوالها واتساعاتها وما عليها من تفرع الأغصان او الأوراق او الزهور والورود.
٤- فرع البئة النباتية والذي يدرس مدى تأثر النباتات بما حولها من مؤثرات .
٥- فرع وظائف النبات الذي يهتم بما يحدث من عمليات حيوية.
٦- فرع امراض النباتات الذي يهتم بما يصيب النباتات من امراض وطرق علاجها والوقاية منها.
٧- فرع وراثة النباتات. ويهتم بمجمل الاختلافات بين عائلات النباتات.
٨- فرع الخلية والذي يهتم بدراسة التركيب والوظيفة للخلايا.
٩- فرع الفطريات والذي يدرس علاقتها بالنباتات (طيفور).
١٠- فرع الطحالب ويدرس خصوصيات الطحالب وتقاربها من النباتات العليا.
١١- فروع لكل من بكتيريا وفيروسات النباتات التي تدرس انواع البكتيريا والفيروسات التي تصيب النباتات ومحاربتها.