بعد التعريف والطرق التي ذكرناها سابقا للفلاحة البيولوجية ، نأتي لأهدافها ، ومن أعظم تلك الأهداف هي ما يخص الإنسان نفسه ، حيث أن المنتوجات والثمار تعطي الفائدة المرجوة منها علي أكمل وجه ، دون الخوف من الاصابة بالأمراض جراء المواد الكيماوية والهرمونات وغيرها ، وهي تحافظ علي صحة ممتازة ، وأيضا الهدف هو الارتقاء بالبيئة الزراعية الخالية من الشوائب والأمراض ، واستخدام الأدوات والطرق البلدية والتقليدية .