تحدث عدوى المهبل الفطرية نتيجةً لحدوث خلل في توازن ما يعرف "" النورمال فلورا " أي الطبقة التي تحتوي على أعداد متوزانة من الفطريلات والبكتيريا النافعة ، ويحدث ذلك عندما يكون هناك مشاكل في جهاز المناعة ، وانخفاضها كما في يحدث في حالات معينة مثل :
** الإصابة بمرض السكري
** ارتفاع مستويات هرمون الإستروجين بسبب الحمل ، أو استخدام موانع الحمل الفموية أو العلاج الهرموني بالإستروجين .
** استخدام أدوية مثبطة للمناعة كما في حالة علاج الأمراض ذاتية المناعة .