الأب يحدد جنس الجنين ؛ حيث أن الكروسوم الجنسي المأخوذ من الحيوان المنوي قد يكون إما X أو Y , أما الكروموسوم الجنسي لأم , فدائماً ما يكون X .
عندما يلقح حيواناً منوياُ يحمل الكروموسوم الجنسي X بويضة تحمل الكروموسوم الجنسي X , يكون جنس الجنين الناتج أنثى XX .
عندما يلقح حيواناً منوياُ يحمل الكروموسوم الجنسي Y بويضة تحمل الكروموسوم الجنسي X , يكون جنس الجنين الناتج ذكر XY .
هناك عدة حالات يكون فيها اختلال في جنس الجنين مثل :
- متلازمة عدم الحساسية للأندروجين ( Androgen Insensitivity Syndrome ) ؛ حيث يحمل الجنين الكروموسوم الجنسي XY ولكن بسبب وجود مقاومة للهرمونات فتتكون الأعضاء الداخلية للأنثى بدون مبيضين , مع وجود خصيتين .
- تضخم الغدة الكظرية الخلقي ( Conginetal Adrenal Hyperplasia ) ؛ حيث يعاني الجنين من وجود الأعضاء التناسلية المشوهة .