يعمل فلوتيكاسون فوروات من خلال آلية غير معروفة للتأثير على عمل أنواع مختلفة من الخلايا المناعية، وعوامل الالتهاب، إلّا أنّ الآلية في التجارب المختبرية التي أجريت على الفئران تتمثل بقدرة مستقبلات فلوتيكازون فيروات على تنشيط مستقبلات الجلوكورتيكويد، وتثبط العامل النووي كابا ب، ومنع تكوّن الالتهاب الرئوي الإيزونوفيلي.