جهاز الرنين المغناطيسي يستخدم طبيا في تصوير الأوردة والشرايين والأنسجة وسوائل الجسم والتغيرات العصبية في الدماغ ويستخدم في تشخيص مرض الصرع من خلال عمل صورة مفصلة للدماغ لتحديد اماكن التلف , ويقوم مبدأ عمل الرنين المغناطيسي على وضع المريض في جهاز وتسليط مجال مغناطيسي قوي عليه ثم بث موجات راديوية لتحفيز البروتونات في ذرات العناصر في جسم المريض على اطلاق اشاراتها وبالتالي تحديد مكانها لرسم صورة دقيقة للمكان كما يستعمل جهاز الرنين المغناطيسي الوظيفي لقياس التغير في تدفق الدم في اجزاء الدماغ عندما تقوم بوظيفتها.