من الممكن ان يتم علاج فطريات الجيوب الانفية بعدة طرق :
- استخدام المناظير الضوئية و هى مناظير يتم استخدامها من اجل ازالة جميع الفطريات الموجودة بداخل الانف و ايضا فتخ الجيوب و ازالة اى اثار فطريات عالقة بها
- اعطاء علاجات مضادة للالتهابات من قبل الطبيب المختص
- تقوية الجهاز المناعى للمريض على مقاومة الفطريات و على عدم الاصابة بها مرة اخرى و تأتى الفكرة من اعطاء ادوية تشبه فى مفعولها اللقاحات و التطعيمات التى تعطى الجسم القوة لمقاومة الفطريات و لا يصاب بها الجسم مرة اخرى