يمكن أداء صلاة الاستخارة عن طريق الوضوء أولا وعزم النية على الصلاة، ومن ثم صلاة ركعتين في الركعة الأولى يستحب قراءة سورة الكافرون بعد الفاتحة، وفي الركعة الثانية سورة الإخلاص، وبعد قراءة التشهد أي قبل التسليم يتم قراءة دعاء الاستخارة وهو اللهم إني أَستخيرُك بعِلمِك، وأستقدِرُك بقُدرتِك، وأسألُك من فضلِك، فإنك تَقدِرُ ولا أقدِرُ، وتَعلَمُ ولا أَعلَمُ، وأنت علَّامُ الغُيوبِ، اللهم فإن كنتَُ تَعلَمُ هذا الأمرَ - ثم يسمى الأمر المطلوب- خيراً لي في عاجلِ أمري وآجلِه - قال: أو في دِيني ومَعاشي وعاقبةِ أمري - فاقدُرْه لي ويسِّرْه لي، ثم بارِكْ لي فيه، اللهم وإن كنتَُ تَعلَمُ أنّه شرٌّ لي في دِيني ومَعاشي وعاقبةِ أمري - أو قال: في عاجلِ أمري وآجلِه - فاصرِفْني عنه، واقدُرْ ليَ الخيرَ حيثُ كان ثم رَضِّني به. ومن ثم التسليم، وبعد ذلك دعاء الشخص بالحاجة نفسها والطلب من الله.