يسبب الشكل غير الطبيعي للقلب مشاكل شديدة في الدورة الدموية، في حالة إصابة الطفل بمرض الجذع الشرياني سوف ينتج عن دوران الدم غير الطبيعي في الجسم ما يأتي:
- مشاكل في التنفس: يسبب التوزيع غير الطبيعي في الدم إلى زيادة تدفق الدم في الرئتين والذي يجعل من الصعب على الطفل أن يتنفس.
- ارتفاع ضغط الدم في الرئتين: تسبب زيادة تدفق الدم إلى الرئتين في تضييق الأوعية الدموية الموجودة في الرئة والذي يسبب زيادة الضغط في الرئتين ويجعل من الصعب على القلب ضخ الدم إلى الرئتين.
- تضخم القلب: يسبب ارتفاع الضغط الرئوي وزيادة تدفق الدم في القلب إلى الضغط على قلب الطفل ليعمل بشكلٍ أكبر والذي يسبب تضخم القلب.
- قصور القلب: زيادة ضغط العمل على القلب ونقص الأكسجين يتسبب في إضعاف قلب الطفل والذي قد يسبب قصور القلب والذي يعني عدم قدرة القلب على إمداد الجسم بالدم الكافي.