هناك عدة صبغات لونية مستخدمة في المختبر لصبغ الكائنات الدقيقة تحت المجهر ومن أشهرها صبغة غرام او قرام وهي عبارة عن استخدام لونين متضادين يتخللهما مادة مثبته ومزيلة وتظهر الجراثيم بلونين الاول يدعى موجبة الغرام والثانية سالبة الغرام ، وايضا هناك صبغة مشهورة لجرثومة السل وهي ايضاً عباره عن صبغتين متضادتين في اللون يتخللهما مادة مزيلة ( حامض) وتظهر جرثومة السل باللون الزهري او الاحمر الفاتح على ساحة زرقاء اللون (طيفور) ، وقليلا ما تستخدم صبغات مركبة مثل صبغة جيمزا Giemsa او استخدام صبغة ثقيلة لصبغ الوسط الموجود فيه الكائنات مثل صبغة الحبر الهندي.