تعتبر متلازمة الطفل المرن عرضا عن كونها حالة مرضية بحد ذاتها وتقسم اسباب الاصابه بها الى :
-اسباب متعلقة بالجهاز العصبي : وذلك في بعض الحالات التي تصيب الجهاز العصبي المركزي مثل الشلل الدماغي والعدوى واصابات الدماغ والحبل الشوكي.
-اسباب غير متعلقة بالجهاز العصبي مثل متلازمة داون.