يتم علاج غدة البارثولين من خلال عمل مغاطس المقعدة التي تعتوي على الكربونات أو اليود المعد للاستخدامك على الجلد وإعطاء المضادات الحيوية المناسبة والتفريغ الجراحي بالشفط أو السحب أو الإجراء الجراحي لاستئصالها بالكامل، ويعتمد اختيار العلاج على الفحص السريري وحالة المريض ونتيجة الخزعة (إن تم إجراؤها)