من أسباب فطريات اللسان عدم المواظبة على تنظيف الفم والأسنان خاصة بعد تناول الطعام، استخدام الكورتيزونات، وحبوب منع الحمل بكثرة. بالإضافة إلى وجود التهابات في المعدة وبعض مشكلات سوء التغذية بما فيه نقص فيتامين ب12، كذلك الإصابة بجفاف الفم وأمراض فقر الدم. التوتر والقلق، والتدخين، والإكثار من تناول المضادات الحيويّة وسوء استخدامها.