سبب صغر المبيض عادة يكون وراثي خلقي، أي لا علاقه له بأي عوامل بيئية، علما أن حجم المبيض يختلف من إمرأة لأخرى ولا يهم حجمه بقدر أدائه وقدرته على التبويض بالإضافة إلى أن حجم البويضة هو الأهم في الإخصاب، ففي الحالات التي يكون فيها حجم البويضة صغير قد تقل فرصة التبويض وبالتالي فرصة الإنجاب وقد يحدث العقم أحيانا، ومن الأسباب الاخرى لضعف التبويض مايلي:
- اضطرابات هرمونية .
- فشل في أحد المبايض او كلاهما .
- مشاكل في الغدة الدرقية
- متلازمة تكيس المبايض
- وجود بعض الأكياس على المبيض