يقع بحر المرجان قبالة الساحل الشمالي الشرقي من استراليا، ويحدها من الشمال الشرقي جزر سليمان، ونجده يندمج من جهة الجنوب مع بحر تسمان، ويتصل من الشمال الغربي مع بحر أورافورا عبر مضيق توريس، ونسبة ملوحة المياه فيه ٣٥٪ وهذه الملوحة تساعد الشعب المرجانية في العيش والتكاثر،